さくらのVPSでrootのSSH接続ができるようにならない。

実現したいこと

前提

＜現状＞
ユーザーアカウントで接続はできますが、
SSL更新のファイル更新がその権限ではできないので、
root権限ユーザーでSSH接続できるようにしたい。

＜使用サーバー＞
さくらVPS

＜設定した内容＞
１. クライアントPC側で秘密鍵と公開鍵を作成。
２. 秘密鍵はローカルの.ssh/に設置。
３. さくらVPSのコントロールパネルの「SSHキー登録」で作成した公開鍵を登録。

発生している問題・エラーメッセージ

上記の設定でSSH接続のコマンドを入れたのですが、
パーミッションエラーが出る状態です。

hogehoge@hoge ~ % ssh root@000.00.000.000 root@000.00.000.000's password: Permission denied, please try again.

試したこと

調べてみて、以下のような対処法が出てきましたが、
今できる接続方法（FTPソフトを使ってユーザーアカウントで接続）では
解決に進むことができず困っている状態です。

■「まずログ（/var/log/secure など）を見る」
→ログインできるユーザーアカウントでは開くことができませんでした。

■「接続先に authorized_keys が設置されているか」
→　公開鍵がある（と思われる） ~/.ssh/ディレクトリの中が見れない。（実際にあるか不明）

Permission denied. Please contact your web hosting service provider for assistance.

■「パーミッションは適切か」
→秘密鍵のパーミッションを600に設定しましたが、
エラー内容は変わりませんでした。

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

Webサーバー：Apache
PC：Mac

初心者なので、不足情報などあればご指摘ください。
どうぞよろしくお願いいたします。