Rを使って特定のデータを削除したい

実現したいこと

Rを使って特定のデータを削除したい

前提

行列に86万ものデータがあるデータセットの中から、3列目の「chrX」「chrY」という名前が付いている行のデータだけを削除したいのですが、削除するコードやパッケージがわかりません。

教えていただけませんでしょうか。

試したこと

subsetのパッケージを使い、(-chrX,-xhrY)でスクリプトを書いてもできませんでした。